Площадь территории заповедника составляет 53,303 тыс.га.
Расположен между 42°47 и 43°20 северной широты и 42°40 и 43°35 восточной долготы.
Статус: Федеральный.
Заповедник состоит из пяти лесничеств: Хазнидонского, Суканского, Верхне-Балкарского, Безенгийского и Чегемского.
Заповедник является единственным высокогорным заповедником Европы. В заповеднике находятся основные вершины Северного Кавказа, средняя высота которых составляет 3910м, здесь сосредоточена половина всех ледников, среди которых все самые крупные, количество которых составляет 152, а их общая площадь 290 км2. Крупнейшими ледниками Кавказа и Европы являются: Безенги, Дых-Тау, Цаннер, Шаурту, Къыш-кара. Толщина этих ледников в средних частях достигает 300-350 м. Ледник Безенги является крупнейшим ледником Кавказа и Европы, длина его составляет 17,6 км, площадь 36,2км2. В народе его называют ледяной король Кавказа.
На территории заповедника находятся все пятитысячники Северного Кавказа кроме Эльбруса и Казбека (Къыш-Къара 5210м, Джангы-Тау 5049м, Къоштан-Тау 5152м, Дых-Тау 5204м, Пик Пушкина 5153м).
Территория заповедника покрыта сетью рек, берущих начало от многочисленных ледников. Основными водными артериями являются реки Чегем, Черек-Балкарский, Черек-Безенгийский, Сукан-Суу, Хазнидон.
Из 13333 га зеленой зоны заповедника 2831 га (6%) представлены лесами;
- 928 га(7%) — зарослями рододендрона;
- 1295 га (9,7%) — субальпийскими лугами;
- 8119 га(60,9%) альпийскими лугами;
- 157 га(1,2%) -субальпийскими пустошами.
